Для определения написания «колышется» или «колышится» нужно вспомнить спряжения глаголов (I и II).
Как правильно пишется?
Только вариант с буквой е в окончании является верным– колышется.
Какое правило применяется?
Для того чтобы определить написание буквы в окончании глагола нужно поставить его в начальную форму (инфинитив). Задаем вопрос – что делать? Колыхать. Глагол заканчивается на -ать, значит он относится к I спряжению. Вспоминаем глаголы-исключения. Колыхать среди них нет. Приходим к выводу, что в окончании пишется буква «е». Следуя этому алгоритму, можно проверять букву в окончании всех глаголов.
Примеры предложений
Похожая статья «Корчёвка» или «корчовка»: как правильно писать?
Как неправильно писать
Самая частая ошибка в окончании, отсюда и неверное написание – колышится.
Это связано с правилом из начальной школы, которое все хорошо запомнили: жи/ши пиши с буквой и. Только это применяется не ко всем частям речи.